Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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