Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SCN9AQ15858 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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