Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
HMGN3Q15651 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC1□□□□□ -2.25
HMGN3Q15651 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
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