Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SCARF1Q14162 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
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