Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
CACNA1CQ13936 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
CACNA1CQ13936 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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