Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
GTF2H3Q13889 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms