Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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DDX39BQ13838 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
DDX39BQ13838 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
DDX39BQ13838 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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