Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 MTCO2P34-201ENST00000421994 607 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CDH18Q13634 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms