Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SRSF5Q13243 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.1 ms