Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
BPTFQ12830 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
BPTFQ12830 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
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