Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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KCNMA1Q12791 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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