Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 A2ML1-201ENST00000299698 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LRRC37A2-201ENST00000333412 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 KIF11-201ENST00000260731 4860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 UTY-216ENST00000624098 3636 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SDHCP3-201ENST00000445371 506 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF667-206ENST00000591790 5250 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ADAM2-201ENST00000265708 2672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SORBS2-221ENST00000437304 3381 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC133041.1-201ENST00000608389 201 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ZNF611-204ENST00000543227 4517 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 RUNDC3A-AS1-202ENST00000588097 5203 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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HOXD11P31277 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 MTURN-202ENST00000324489 5605 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
HOXD11P31277 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 C9orf131-205ENST00000421362 3259 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL590065.1-201ENST00000603371 4774 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
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HOXD11P31277 EIF4G3-201ENST00000264211 5802 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 PTK2-240ENST00000522684 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC010247.1-201ENST00000527895 759 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC006262.3-201ENST00000597337 258 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 AC108099.1-201ENST00000564402 3258 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
HOXD11P31277 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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