Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SDAD1-201ENST00000356260 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 OR6N2-202ENST00000641131 3455 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 OTX2-AS1-201ENST00000534909 2428 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNF14-204ENST00000394519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC093270.2-201ENST00000486157 792 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 MPP5-204ENST00000555925 5006 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
RBM42Q9BTD8 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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