Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
CCBE1Q6UXH8 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CCBE1Q6UXH8 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms