Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TPRNQ4KMQ1 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
TPRNQ4KMQ1 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
TPRNQ4KMQ1 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
TPRNQ4KMQ1 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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