Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
LAMA3Q16787 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
LAMA3Q16787 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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