Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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TNXAQ16473 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2□□□□□ -2.09
TNXAQ16473 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2□□□□□ -2.09
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