Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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CNGA3Q16281 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
CNGA3Q16281 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
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