Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CHRNA6Q15825 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CHRNA6Q15825 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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