Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
CNN3Q15417 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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