Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
PUM3Q15397 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
PUM3Q15397 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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