Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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GPNMBQ14956 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GPNMBQ14956 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
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