Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.56
COL9A3Q14050 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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COL9A3Q14050 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A3Q14050 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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