Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
TRIM28Q13263 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
TRIM28Q13263 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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