Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CHAF1BQ13112 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CHAF1BQ13112 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms