Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 Z85994.2-201ENST00000434327 452 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
CHD3Q12873 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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