Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
KCNMA1Q12791 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
KCNMA1Q12791 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms