Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PTPREP23469 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPREP23469 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPREP23469 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PTPREP23469 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PTPREP23469 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
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