Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
FOXQ1Q9C009 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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FOXQ1Q9C009 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXQ1Q9C009 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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