Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SGCBQ16585 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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