Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
DDB1Q16531 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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DDB1Q16531 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
DDB1Q16531 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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