Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 DPY19L2P1-203ENST00000458672 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
TNXAQ16473 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms