Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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SS18Q15532 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SS18Q15532 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
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