Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
SHHQ15465 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SHHQ15465 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
SHHQ15465 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2.01
SHHQ15465 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SHHQ15465 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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