Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRKQ15262 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRKQ15262 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRKQ15262 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRKQ15262 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
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PTPRKQ15262 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
PTPRKQ15262 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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