Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
SCARF1Q14162 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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