Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
RUNX2Q13950 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms