Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
GTF2H3Q13889 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.3 ms