Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
HDAC1Q13547 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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