Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SMAD4Q13485 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms