Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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FOXE3Q13461 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FOXE3Q13461 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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