Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
PDE3BQ13370 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PDE3BQ13370 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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