Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ITGB3BPQ13352 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ITGB3BPQ13352 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.4 ms