Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SKP2Q13309 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms