Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
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TRDNQ13061 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRDNQ13061 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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TRDNQ13061 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
TRDNQ13061 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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