Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC025678.1-201ENST00000567861 338 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
VPREB1P12018 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms