Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SOGA3Q5TF21 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
SOGA3Q5TF21 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms