Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
GEN1Q17RS7 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
GEN1Q17RS7 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms