Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 RNA5SP143-201ENST00000516936 115 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CCDC142Q17RM4 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CCDC142Q17RM4 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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