Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
CLPPQ16740 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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